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MIT分子生物学8.6 NMD mRNA识别过程,关键因子和信号通路

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对于无义介导的衰变,我们首先想知道的是,如何识别具有提前终止密码子的mRNA?从现在起,这将被称为PTC。因此,我想指出的第一件事是,在真核细胞的正常终止中,很明显,有某种机制与polyA结合蛋白的接近程度和刺激这种终止的终止位点有关。

这个机制是什么有点不清楚。有一些模型表明,polyA结合蛋白以某种方式直接相互作用。你可以看到这在这里有点暗示。我认为没有确凿的证据证明这一点。还有其他模型表明,实际上是形成这种封闭环结构的过程以某种方式刺激终止,而polyA结合蛋白是导致终止的原因,因此,当你去掉它时,你会看到不太好的终止——不是因为它的直接作用,而是因为它能够使RNA循环。

所以在正常情况下,这种核糖体会迅速终止,释放,然后正常结束翻译,而你的mRNA只会受到我们在上一节课中讨论的正常降解机制的影响。

因此,这给了蛋白质与eRF3结合的时间。记住,有一个eRF1,1可以识别所有三个终止密码子,它是大肠杆菌蛋白的RF1 RF2类似物,适合A位点。然后eRF3是这些翻译GTP酶之一。因此,我们反复讨论了这些与核糖体60S亚基相互作用时结合并被刺激水解GTP的蛋白。

MIT 分子生物学 part3 3.14 Eukaryotic Translation Termination and Ribo - 哔哩哔哩 (bilibili.com)​

因此,结果表明,该外显子连接模型中的UPF1以及另一种蛋白SMG1通过与eRF3的相互作用而被招募,该相互作用随后通过与与外显子结合复合物结合的其他两种UPF蛋白的相互作用来稳定。

所以这里有两件事。其想法是,与eRF3的初始交互。

所以他们的想法是扫描,寻找过早终止密码子。当您与



所以在其他生物中,它们有我称之为的--,我将称之为3’UTR模型,其想法是,这是严格基于接近聚腺苷酸化位点的基础上工作的。


你会注意到,我这里没有SMG1,这是因为在某些生物中,没有SMG1。这将在NMD(无意义介导衰变)方法中发挥关键作用,但在非NMD方法中,它将不那么重要。

MIT 分子生物学 part3 8.4 Discovery of Nonsense-Mediated Decay, Part 1 - 哔哩哔哩 (bilibili.com)​




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